Um dos pesadelos ao gerir sistemas com bases de dados grandes de queries complexos é ajustar o servidor Mysql adequadamente.
Uma ferramenta interessante é o tuning-primer
para utilizar esta ferramenta em Centos 6 basta executar no terminal:
wget https://launchpadlibrarian.net/78745738/tuning-primer.sh
sh tuning-primer.sh
Depois basta comparar as sugestões como ficheiro my.cnf para tal utilize o editor vim ou outro:
vi /etc/my.cnf
para editar o ficheiro pressione a tecla INS
quando terminal pressione a tecla ESC
para salvar as alteração digite :x e pressione Enter